Если вы проводите инвентаризацию маркированного товара, то в документе можно также инвентаризировать и марки:

Есть несколько вариантов создания описей. Наиболее распространенный с помощью ТСД:


После добавления описи, ее нужно сохранить (Ок или Сохранить внизу формы).

Если при создании описи из ТСД не подтянулись марки, тогда можно сделать вторым способом:
Как отсканировать марки в документ ТСД описано в статье Создание на ТСД спецификации с маркированным товаром.
марки из документа ТСД будут импортированы в опись
ИЛИ
Марки можно добавить вручную, отсканировав в поле Штрихкод товара 
Есть возможность сбросить все марки в описи, для этого нужно стать на любую строку в колонке Кол-во марок, вызвать подменю правой клавишей мыши и выбрать там Сбросить все марки - марки сбросятся по всем строкам в описи.

3. На вкладке Сличительные ведомости после нажатия кнопки Заполнить остатки система сравнит данные в описи с остатками в системе как по товарам, так и помаркам. На вкладке Марка можно просмотреть результат инвентаризации марок.
4. После проведения инвентаризации остаток марок выравнивается в соответствии с документом. Постановка на учет/списание марки инвентаризацией отображается на форме Склад - Марки на вкладке Операции

