Магазин - это склад торговый объект, который ведет розничную продажу товаров физическим лицам.

...

Может вестись как партионный учет, так и учет по товарам. Допускается ведение учета в розничных ценах.

Отдел магазина

Строго говоря, магазин в системе не является складом, складом является отдел магазина, и по отделу ведется учет. Поэтому у магазина должен быть введен хотя бы один отдел.

Каждый магазин может состоять из нескольких отделов, каждый из которых может иметь свое собственное материально-ответственное лицо.

Следует отметить, что сам магазин складом не является. Поэтому, чтобы вести на нем учет, у него должен быть введен хотя бы один отдел.